गंगा बेसिन राज्यों में बाढ़ और इसके प्रबंधन से निपटने के लिए, गंगा बाढ़ नियंत्रण आयोग का गठन वर्ष 1972 में भारत सरकार के संकल्प संख्या एफ.सी.47(3)/72 दिनांक 18-4-1972 के तहत जल संसाधन मंत्रालय के अधीनस्थ कार्यालय के रूप में और गंगा बाढ़ नियंत्रण बोर्ड के सचिवालय और कार्यकारी अंग के रूप में किया गया था, जिसका मुख्यालय पटना में है।